عنوان:
کلونینگ توالی کامل ژنوم ویروس موزائیک توتون
چکیده فارسی
ویروس موزائیک توتون (TMV) ، یکی از مهمترین عوامل بیماریزا در سراسر آفاق است که بیش از 200 گونه گیاهی را آلوده باده نماید. هر یک از اجزای جوراجور ژنوم دارای نقش مهمی باب ساختار ژنوم ویروس می باشد، از تمام پروتئین حرکتی که در تحرک سلول به سلول در TMV موثراست و پروتئین پوششی که نقش مهمی باب پایداری و انتقال ویروس ایفا میکند. درایران در خصوص بازشناخت توالی تام ژنوم ویروس موزائیک توتون تا کنون اقدامی صورت نگرفته است. لذا تعیین توالی ویروس و خواندن اختلاف های جدایه های موجود در کشور با اطلاعات حاضر باب منابع از جمله اقدامات اولیه و ضروری جهت انجام مطالعات مولکولی روی این ویروس است، بنابراین با آماج بررسی توالی ژن کدکننده پروتئین حرکتی و پروتئین پوششی در جدایه گزارش شده از ایران و مقایسه توالی تعیین ترادف شده با جدایه های مختلف در بانک ژن NCBI مطالعه اسم انجام شد. توالی ژن کدکننده این پروتئین ها در جدایه های مناطق مختلف دنیا گزارش شده است. استخراج RNA ژنومی ویروس از برگ گیاهان توتون آلوده بدست آمد و با استعمال از پرایمر PSh60-R1 مرحله ساخت cDNA انجام شد. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی PSh63-F و PSh60-R1 بخش کدکننده پروتئین حرکتی و پروتئین پوششی تکثیر و بصورت دو جهته توالی یابی شد. همردیفی توالی بدست آمده با توالی مشابه از نژادهای جوراجور انجام شد و درخت خویشاوندی رسم گردید. نتایج نشان انصاف جدایه اعلام شده از ایران با نژاد TMV-U1 قرابت بالائی دارد. از بین 799 جایگاه در سطح نوکلئوتید برای پروتئین حرکتی 6 جهش در مقایسه با نژاد TMV-U1 مشاهده و در مجموع 266 اسید آمینه 2 جهش دیده شد. آنالیزهای انجام شده براساس توالی نوکلئوتیدی کد کننده ناحیه پروتئین پوششی ویروس باب تشبیه با اصل TMV-U1 2 جهش در روی نوکلئوتید را آرم داد. در توالی های بالادست و بینابین دو ژن کدکننده پروتئین پوششی و حرکتی نیز پرش هایی دید شد. پرش در این مناطق به دلیل نقش تنظیمی باب بیان ژن حائز اهمیت است.
سیاهه مطالب
آغاز صفحه
فصل اول:کلیات تحقیق........................................................................................................1
1-1- ویروس موزائیک توتون...............................................................................................1
1-2- خصوصیات فیزیکی ویروس........................................................................................2
1-3- اهمیت ویروس موزائیک توتون....................................................................................2
1-4- اهداف مطالعه...................................................................................................... .......4
فصل دوم: مبانی نظری و پیشینه تحقیق
2-2-جزئیات ویروس (خصوصیات فیزیکی)
2-6-همانندسازی (رونوشت ویروس در یاخته میزبان)
2-7-ساختار ژنوم و ORF ها و نواحی غیر کد شونده
2-7-1- عملکرد پروتئینهای ویروس
2-7-1-2- پروتئین 126 و 183 کیلو دالتون
2-9- کارهای انجام شده در خصوص ویروس موزائیک توتون
3-2-1- آییننامه 1: مراحل استحصال RNA از بافت گیاه حرف استفاده از کیت
3-4- آنالیز بیوانفورماتیک و طراحی آغازگرها
3-4-1- بازیابی توالی ژنوم ویروس موزائیک توتون
3-4-2- همردیفی جدایه های مختلف ویروس به سمت غرض طراحی آغازگرها
3-5- بهینه سازی تکثیر قطعه کامل ژنوم ویروس موزائیک توتون حرف استفاده از آغازگرهای اختصاصی مختلف..................................................................................................... ......
3-5-2- واکنشNested PCR حرف آغازگرهای (PSh60F/PSh60R2) با استفاده از DNA تکثیر شده باکیتLong
عنوان :
بودجه و برنامه های عمرانی
فهرست امعان مشکلات طرح های عمرانی دولت عوامل ایجاد تاخیر در برنامه های عمرانی در خارج از
کشور عوامل تاخیر در برنامه های عمرانی در ایران دوستی با آیین های نوین اجرای طرح های عمرانی اعتبار به عنوان یکی از مهمترین آلت برنامه های اجرایی است که اهداف اندکی و کیفی ، سیاست ها و
الفبا مشی های اساسی پروگرام را اساس گرفته و شرایط
اجرای آن را تعیین و محقق
می سازد. ایضاً بودجه
آبگینه تمام نمای پروگرام ها و پرکاری های دولت است و نقش انبوه مهم و حیاتی در توسعه اقتصاد ملی ایفا
می نماید(کیومرثی،1387،ص1) تاکنون چهار تعریف رسمی باب رسم محاسبات عمومی ارض راجع به
اعتبار مطرح شده که جدیدترین آنها مرتبط به قانون محاسبات عمومی ارض مصوب 10/6/1366 مجلس شورای اسلامی است. باب ماده یک این قانون ، بودجه بیمو کشور چنین تعریف
مقدمه
عنوان:
کلونینگ توالی کامل ژنوم ویروس موزائیک توتون
چکیده فارسی
ویروس موزائیک توتون (TMV) ، یکی از مهمترین عوامل بیماریزا در سراسر آفاق است که بیش از 200 گونه گیاهی را آلوده باده نماید. هر یک از اجزای جوراجور ژنوم دارای نقش مهمی باب ساختار ژنوم ویروس می باشد، از تمام پروتئین حرکتی که در تحرک سلول به سلول در TMV موثراست و پروتئین پوششی که نقش مهمی باب پایداری و انتقال ویروس ایفا میکند. درایران در خصوص بازشناخت توالی تام ژنوم ویروس موزائیک توتون تا کنون اقدامی صورت نگرفته است. لذا تعیین توالی ویروس و خواندن اختلاف های جدایه های موجود در کشور با اطلاعات حاضر باب منابع از جمله اقدامات اولیه و ضروری جهت انجام مطالعات مولکولی روی این ویروس است، بنابراین با آماج بررسی توالی ژن کدکننده پروتئین حرکتی و پروتئین پوششی در جدایه گزارش شده از ایران و مقایسه توالی تعیین ترادف شده با جدایه های مختلف در بانک ژن NCBI مطالعه اسم انجام شد. توالی ژن کدکننده این پروتئین ها در جدایه های مناطق مختلف دنیا گزارش شده است. استخراج RNA ژنومی ویروس از برگ گیاهان توتون آلوده بدست آمد و با استعمال از پرایمر PSh60-R1 مرحله ساخت cDNA انجام شد. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی PSh63-F و PSh60-R1 بخش کدکننده پروتئین حرکتی و پروتئین پوششی تکثیر و بصورت دو جهته توالی یابی شد. همردیفی توالی بدست آمده با توالی مشابه از نژادهای جوراجور انجام شد و درخت خویشاوندی رسم گردید. نتایج نشان انصاف جدایه اعلام شده از ایران با نژاد TMV-U1 قرابت بالائی دارد. از بین 799 جایگاه در سطح نوکلئوتید برای پروتئین حرکتی 6 جهش در مقایسه با نژاد TMV-U1 مشاهده و در مجموع 266 اسید آمینه 2 جهش دیده شد. آنالیزهای انجام شده براساس توالی نوکلئوتیدی کد کننده ناحیه پروتئین پوششی ویروس باب تشبیه با اصل TMV-U1 2 جهش در روی نوکلئوتید را آرم داد. در توالی های بالادست و بینابین دو ژن کدکننده پروتئین پوششی و حرکتی نیز پرش هایی دید شد. پرش در این مناطق به دلیل نقش تنظیمی باب بیان ژن حائز اهمیت است.
سیاهه مطالب
آغاز صفحه
فصل اول:کلیات تحقیق........................................................................................................1
1-1- ویروس موزائیک توتون...............................................................................................1
1-2- خصوصیات فیزیکی ویروس........................................................................................2
1-3- اهمیت ویروس موزائیک توتون....................................................................................2
1-4- اهداف مطالعه...................................................................................................... .......4
فصل دوم: مبانی نظری و پیشینه تحقیق
2-2-جزئیات ویروس (خصوصیات فیزیکی)
2-6-همانندسازی (رونوشت ویروس در یاخته میزبان)
2-7-ساختار ژنوم و ORF ها و نواحی غیر کد شونده
2-7-1- عملکرد پروتئینهای ویروس
2-7-1-2- پروتئین 126 و 183 کیلو دالتون
2-9- کارهای انجام شده در خصوص ویروس موزائیک توتون
3-2-1- آییننامه 1: مراحل استحصال RNA از بافت گیاه حرف استفاده از کیت
3-4- آنالیز بیوانفورماتیک و طراحی آغازگرها
3-4-1- بازیابی توالی ژنوم ویروس موزائیک توتون
3-4-2- همردیفی جدایه های مختلف ویروس به سمت غرض طراحی آغازگرها
3-5- بهینه سازی تکثیر قطعه کامل ژنوم ویروس موزائیک توتون حرف استفاده از آغازگرهای اختصاصی مختلف..................................................................................................... ......
3-5-2- واکنشNested PCR حرف آغازگرهای (PSh60F/PSh60R2) با استفاده از DNA تکثیر شده باکیتLong